Цифровая ПЦР простыми словами

Цифровая ПЦР или digital PCR - это метод высокоточного измерения количества ДНК или РНК в образце. Представьте, что вы разделили один обычный ПЦР образец на множество мелких отдельных реакций, как если бы вскрыли одну большую упаковку M&Ms и подсчитали бы сколько в упаковке всего M&Ms и сколько из них содержит орешек. Так и здесь анализируется каждая маленькая независимая реакция на предмет наличия в нем интересующего нас фрагмента ДНК (Miyaoka et al., 2016; Pecoraro, 2019). Интересно, что цифровая ПЦР не требует эталона или стандартной кривой для определения количества ДНК, в отличие от других методов, таких как количественная ПЦР в реальном времени. Это происходит потому, что цифровая ПЦР подсчитывает наличие или отсутствие ДНК в каждой реакционной капельке, и подобно цифровому сигналу устанавливает "есть" или "нету", "1" или "0", отсюда и закрепилось название "цифровая" ПЦР (Nazir, 2023; Pecoraro, 2019). Таким образом, цифровая ПЦР - это мощный инструмент для обнаружения и количественного определения ДНК/РНК, который находит применение в самых разных областях - от медицинской диагностики до сельского хозяйства. Он особенно полезен для выявления редких генетических событий и для обеспечения абсолютного количественного определения без необходимости использования дополнительных эталонов (Miyaoka et al., 2016; Wainman et al., 2024). Технология развивается и включает в себя различные передовые методы, а также переходит к более портативным и экономически эффективным системам (Sreejith et al., 2018). Точность и способность к мультиплексированию, то есть одновременному измерению нескольких ДНК-мишеней, делают этот метод ценным как в исследовательских, так и в клинических условиях (Cao et al., 2016; Gaňová et al., 2021).

______

Научный сотрудник НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ,
к.м.н. Слепцов А.А.