Компания |
Crude |
ВЭЖХ |
ПААГ |
ВЭЖХ+ПААГ |
RP or С18 |
IEX |
SEC |
HIC |
NA |
- |
+ |
+ |
+ |
+ |
- |
- |
|
NA |
+ |
+ |
NA |
Inf |
- |
- |
- |
|
+ |
+ |
+ |
+ |
- |
- |
- |
- |
|
NA |
+ |
+ |
+ |
- |
- |
- |
- |
|
NA |
+ |
Inf |
NA |
+ |
- |
- |
- |
|
Inf |
Inf |
Inf |
Inf |
Inf |
Inf |
Inf |
Inf |
|
- |
+ |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
|
БИОССЕТ** |
+ |
+ |
+ |
NA |
+ |
- |
- |
- |
NA |
+ |
+ |
NA |
- |
- |
- |
- |
|
NA |
+ |
Inf |
- |
- |
- |
- |
- |
|
Inf |
Inf |
Inf |
Inf |
Inf |
Inf |
Inf |
Inf |
|
NA |
+ |
+ |
NA |
+ |
- |
- |
- |
* NA – данных
нет; не заявляется
* Inf – информация не
подтверждена
* Crude – крюд, продукт без очистки
* ВЭЖХ (HPLC) - очистка с помощью высокоэффективной
жидкостной хроматографии
* ПААГ – очистка методом электрофореза в полиагриламидном геле
* RP (RP-HPLC) или С18 – картриджи для ВЭЖХ с обращенной фазой
* IEX (IEX-HPLC) - картриджи для ионообменной ВЭЖХ
* SEC – эксклюзионная хроматография
* HIC - гидрофобная хроматография взаимодействия
** Не
производит зонды
Дополнительная информация
Некоторые нюансы синтеза олигов:
· Чем длиннее желаемый продукт, тем ниже минимальный конечный выход. Например, для синтеза праймера длиной в 20 оснований, минимальный выход составит 75%, а при 35 оснований 60%. То есть остальной объем, это примеси, которые необходимо очистить и чем длиннее продукт, тем грязнее продукт.
· Чем выше содержание GC (GC-content, %) в последовательности олигонуклеотидов тем хуже очистка, в связи с образованием высокостабильных вторичных структур.
Нюансы при заказе очистки в ПААГ:
· Используется преимущественно для очистки зондов.
· Для < 25 оснований очистка возможно до 95-99% чистоты.
· Для > 30 оснований очистка возможна до 85-90%.
· Подходит также для очистки длинных продуктов, более 40 оснований.
· Эффективность очистки с помощью ПААГ возможна до 10 ОЕ (оптических единиц), чем выше, тем сильно хуже.
Нюансы при заказе очистки на ВЭЖХ (HPLC):
· Используется для очистки немодифицированных олигонуклеотидов, подходит в основном для стандартной ПЦР без зондов.
· Эффективная очистка возможна до 50 оснований.
Нюансы при заказе очистки на RP-HPLC или С18:
· Универсальный метод очистки, включая очистку зондов.
· Эффективно очищает олигонуклеотиды длиной не более 50 п.о.
Нюансы при заказе очистки на IEX-HPLC:
· Используется для очистки длинных олигонуклеотидов (40-80 п.о.) для NGS или direct cloning.
· Чистота ≥ 85%.