Приборы по цифровой ПЦР 2024 [ Доступно для СНГ ]
Прежде чем перейти к разбору оборудования небольшой дисклеймер:
"Приведенная ниже информация отражает личное мнение и опыт. Данная информация не является индивидуальной рекомендацией или окончательным руководством. Обратитесь к соответствующим экспертам и ресурсам, чтобы получить персональные рекомендации с учетом вашей ситуации."
В дополнение к предыдущему посту.
В связи с тем, что каждый прибор по-своему уникальный, то рассмотрит основные отличительные особенности, не вдаваясь в технологические различия.
Bio-Rad QX200 Droplet Digital PCR System
Разработчик: Bio-Rad Laboratories (США)
Мин-макс капель на образец: 20 тыс.
Мин-макс образцов за запуск: 8-96
Полная мощность за один запуск: 96 образцов до 20 тыс. капель
Количество каналов: 2
На рынке с: 2011
Комментарий: рабочая лошадка во многих лабораториях мира.
Плюсы: 96 образцов до 20 тыс. капель. Градиента на любом Bio-Rad совместимом имеющимся амплификаторе. Совместима с многоканальной пипеткой.
Минусы: Ручной труд, нюансы запуска. Минимум 8 образцов. Запуск только кратно 8 образцам.
Bio-Rad QX Dx AutoDG (комплект для QX200)
Разработчик: Bio-Rad Laboratories (США)
Плюсы: робот, облегчающий работу на QX200.
Минусы: свои расходные материалы (не совместимые по форм-фактору с QX200).
Bio-Rad QXONE Droplet Digital PCR System
Разработчик: Bio-Rad Laboratories (США)
Мин-макс капель на образец: 20 тыс.
Мин-макс образцов за запуск: 8-480
Полная мощность за один запуск: 480 образцов до 20 тыс. капель (т.е. помещается 5 плашек по 96)
Количество каналов: 4
На рынке с: 2020
Плюсы: Робот. Высокая мощность. Встроен градиентный амплификатор.
Минусы: Минимум 8 образцов. Запуск только кратно 8 образцам.
Bio-Rad QX600 Droplet Digital PCR System
Разработчик: Bio-Rad Laboratories (США)
Мин-макс капель на образец: 20 тыс.
Мин-макс образцов за запуск: 8-96
Полная мощность за один запуск: 96 образцов до 20 тыс. капель
Количество каналов: 6
На рынке с: 2022
Плюсы: те же; 6 каналов.
Минусы: Минимум 8 образцов. Запуск только кратно 8 образцам. Зонд на 6 канал ATTO590 имеет высокую стоимость, минимальная стоимость зонда с 5'ATTO590N составляет 200$ (>100 тыс. ₸; ~700 Br).
QIAGEN QIAcuity Digital PCR System
Разработчик: QIAGEN (Голландия)
Мин-макс капель на образец: 8-26 тыс.
Мин-макс образцов за запуск: 24-96
Полная мощность за один запуск:
QIAcuity One: 1 плашка: 24 образцов по 26 тыс. кап. или 96 образцов по 8 тыс. кап.
QIAcuity Four: 4 плашки.
QIAcuity Eight: 8 плашек.
Количество каналов: 2 (QIAcuity One), 5 (QIAcuity Four/Eight)
На рынке с: 2020
Плюсы: Градиент на 12 точек (есть не всегда, уточняйте у менеджеров). Совместим с многоканалками.
Минусы: Минимальный запуск 24 или 96 образца, технически вы можете запустить 1 образец, но физически будет использована 1 плашка.
Thermo Fisher QuantStudio 3D Digital PCR System
Разработчик: Thermo Fisher Scientific (США)
Мин-макс капель на образец: 20 тыс.
Мин-макс образцов за запуск: 1
Полная мощность за один запуск: 1 до 20 тыс. капель
Количество каналов: 2
На рынке с: 2014 (снят с производства в 2023, но есть в продажах)
Плюсы: очень дешевый, ну наверное и всё.
Минусы: 1 чип. Ручной запуск. Нужно докупить амплификатор с плоским блоком, совместимый с чипами QuantStudio 3D. Снят с производства.
QuantStudio Absolute Q Digital PCR System
Разработчик: Combinati, купленная в 2021 году компанией Thermo Fisher Scientific (США)
Мин-макс капель на образец: 20 тыс.
Мин-макс образцов за запуск: 16
Полная мощность за один запуск: 16 до 20 тыс. капель
Количество каналов: 4
Комментарий: для 3-го канала необходима ABY-QSY проба (Thermo), альтернатив нет. Для 4-го канала вместо JUN-QSY пробы можно использовать Cy5.
На рынке с: 2022
Плюсы: -
Минусы: Ручной запуск. Не совместим с многоканалкой. Запуск 16 образцов минимум.
Менее известные платформы
Stilla Technologies Naica System
Разработчик: Stilla Technologies (США)
Мин-макс капель на образец: более 20 тыс.
Мин-макс образцов за запуск: 4-16
Полная мощность за один запуск: 16 со свыше 20 тыс. капель
Количество каналов: 3 (Naica Prism3) и 6 (Naica Prism6)
Комментарий: у Naica Prism6 второй канал на YY-пробу (Yakima Yellow), третий на Atto550 или TAMRA, нет поддержки VIC/HEX (Naica Prism6).
Nio и Nio+
Разработчик: Stilla Technologies (США)
Мин-макс капель на образец: более 20 тыс.
Мин-макс образцов за запуск: 8-768
Полная мощность за один запуск: 768 со свыше 20 тыс. капель
Количество каналов: 7
Комментарий: очень редкий 7 канал на DY-521-XL.
Fluidigm BioMark HD
Разработчик: Fluidigm (США)
Макс капель на образец: до 9 тыс.
Количество образцов за запуск: 96
Полная мощность за один запуск: 96 до 9 тыс. капель
Количество каналов: 4
Комментарий: многоразовый чип для генерации капель.
Материал подготовил
KOL, к.м.н. Слепцов А.А.